Polypeptide at Protina
Ang mga polypeptides at protina ay likas at napakahalagang organikong compounds ng isang cell. Ang mga ito ay parehong binubuo ng mga amino-acids. Ang mga amino-acids ay natural na mga senyales na magkasama upang bumuo ng peptides, polypeptides, at mga protina. Ang bawat amino-acid ay naglalaman ng isang amine (-NH2) at isang hydroxyl (-COOH) na pangkat, pati na rin ang isang tiyak na kadena sa gilid (R group). Ang grupong chain side ay nag-iiba sa laki, hugis, singil, at reaktibiti, at samakatuwid ay natatangi sa bawat amino-acid. Mayroong 20 uri ng monomeric amino-acids na may kakayahang magkaugnay sa magkakaibang mga kumbinasyon, sa gayon ay nagbibigay ng mga polypeptide at mga protina na may mataas na pagkakaiba-iba.
Ano ang polypeptide?
Ang isang polypeptide ay isang polimer na may tinukoy na pagkakasunud-sunod ng mga amino-acids na naka-link sa pamamagitan ng covalent bonds ng peptide. Ang isang peptide bond ay ang resulta ng isang reaksyon ng paghalay sa pagitan ng dalawang amino-acids: ang carboxyl group ng isang amino-acid ay tumutugon sa amino group ng isang katabi amino acid, na naglalabas ng isang molecule ng tubig (H2O). Ang mga maikling chain ng amino-acids na naka-link sa pamamagitan ng mga peptide bond ay tinutukoy bilang peptides. Karaniwang nabuo ang peptides ng hanggang 20-30 amino-acids. Ang mas mahahabang kadena ng naka-link na residues sa amino-acid na may isang partikular na pagkakasunod-sunod ay tinatawag na polypeptides. Ang polypeptides ay maaaring maglaman ng hanggang sa 4000 residues. Ang mga polypeptides ay nailalarawan sa pamamagitan ng isang backbone polypeptide na nabuo sa pamamagitan ng paulit-ulit na pagkakasunod-sunod ng mga atomo sa core ng naka-link na chain ng amino-acids. Nakalakip sa polypeptide backbone ang mga partikular na chain ng amino-acids, ang grupong R. Ang mga polypeptides ay maaaring tumiklop sa isang nakapirming istraktura na bumubuo ng protina. Ang isang polypeptide ay bumubuo ng samakatuwid ang linear sequence ng mga amino-acid residues na bumubuo sa pangunahing istraktura ng isang protina.
Ano ang isang protina?
Ang mga protina ay mga structurally at functionally complex molecules. Ang terminong protina ay ginagamit upang ilarawan ang tatlong-dimensional na istraktura na nabuo sa pamamagitan ng pagtitiklop ng isa o higit pang mga polypeptides. Ang mga protina ay nagpapakita ng apat na antas ng estruktural organisasyon, na ang polypeptide ang pangunahing istraktura. Ang isang protina ay may pangalawang istraktura kapag ang mga polypeptide chain ay bumubuo ng α helices at β sheets. Ang istruktura ng tertiary na protina ay bumubuo sa buong tatlong-dimensional na organisasyon ng isang polypeptide chain. Kapag higit sa isang polipeptide chain ay kasangkot sa protina complex, ang istraktura ng protina ay itinalaga bilang quaternary. Ang natitiklop na polypeptide chains upang bumuo ng isang protina ay batay sa maraming mahina na mga covalent bond na nabuo sa pagitan ng iba't ibang bahagi ng isang chain o kahit na dalawa o higit pang mga polypeptide chain. Ang mga non covalent bonds ay kinabibilangan ng mga atoms ng polypeptide backbone pati na rin ang mga grupong gilid ng R grupo, at may tatlong uri: mga hydrogen bond, ionic bond, at van der Waal bond. Ang mga malalaking numero ng mahihirap na mga covalent bond ay kumilos nang magkakasabay at ang kanilang lakas ay pinagsama upang matiyak ang katatagan ng isang nakatiklop na istraktura ng protina. Ang isang substructure ng samahan ng protina ay ang domain ng protina. Ito ay binubuo ng anumang bahagi ng isang kadena ng polypeptide na maaaring tumiklop nang nakapag-iisa sa isang matatag na istraktura. Ang bawat domain ay naglalaman ng 40 at 350 amino-acids. Ang pinakamaliit na protina ay nagtatanghal ng isang domain habang ang isang malaking protina ay maaaring maglaman ng hanggang sa maraming dosenang mga domain. Ang bawat domain ng protina ay karaniwang nauugnay sa isang natatanging function. Ang mga katangian ng pagganap ng mga protina ay nakasalalay sa kalakhan sa kanilang istraktura at hugis na nagbibigay-daan sa kanila na makipag-ugnay nang pisikal sa iba pang mga molecule. Ang mga pakikipag-ugnayan na ito ay palaging tiyak at pumipili. Ang bawat protina ay maaaring magbigkis sa mga ligand na may-bisang mga site na may mataas na pagkakahawig sa isa o lamang ng ilang mga molecule na kilala bilang ligands. Ang ligand-binding site ay isang cavity sa ibabaw ng protina na nabuo sa pamamagitan ng pagtitiklop ng polypeptide chain. Ang magkakahiwalay na mga ligand na may-bisang mga site sa isang protina ay maaaring magbigkis sa iba't ibang ligands, kumokontrol sa function ng protina, o pagtulong upang ilipat ang protina sa isang partikular na site sa cell. Ang protina function ay nakasalalay malapit sa istraktura nito. Ang pagbabago sa isang amino-acid ay maaaring makagambala sa hugis nito at maging sanhi ng pagkawala ng pag-andar.
Pagkakaiba sa pagitan ng polypeptide at protina
Ang isang polypeptide ay isang polimer na nabuo sa pamamagitan ng isang tinukoy na pagkakasunud-sunod ng mga amino-acids na naka-link nang magkasama sa pamamagitan ng covalent peptide bonds.
Ang isang protina ay isang structurally at functionally complex molecule na nabuo sa pamamagitan ng pagtitiklop ng isa o maraming mga polypeptide chains.
Ang isang polypeptide ay nagtatanghal ng isang simpleng istraktura at binubuo ng polypeptide backbone na nabuo sa pamamagitan ng paulit-ulit na pagkakasunod-sunod ng mga atoms sa core ng naka-link chain amino-acids. Nakalakip sa polypeptide backbone ang mga partikular na chain ng amino-acids, ang grupong R
Ang isang protina, sa kabilang panig, ay isang kumplikadong molecule na binubuo ng isa o higit pang mga chain ng polypeptide na natitiklop sa sekundaryong, tertiary o quaternary na istraktura.
Ang protina hugis ay matatag sa pamamagitan ng tatlong uri ng mahina non covalent bono: hydrogen Bonds, ionic bono, at van der Waal bono.
Ang pangunahing pag-andar ng isang polypeptide ay ang pangunahing istraktura ng mas kumplikadong mga protina. Ang kakulangan ng polypeptides ay tatlong-dimensional na istraktura na nagbibigay-daan sa isang protina na magbigkis sa isang ligand at maging functional.
Sa kabilang panig, ang pagiging kumplikado ng istruktura ng isang protina, ang matatag na hugis nito na may mga ligand na may-bisang mga site ay nagbibigay-daan ito upang mahigpit na isailalim at may mataas na kaugnayan sa mga partikular na ligand, upang maging regulado, at makilahok sa maraming mahahalagang cellular metabolic pathways.
Polypeptide versus Protein: Comparioson Table
Buod ng polypeptide kumpara sa protina
Ang mga polypeptides at mga protina ay natural na nagaganap at napakahalagang organikong compound ng isang cell.
Habang ang amino-acids ay ang kanilang karaniwang pangunahing bahagi, ang mga polypeptide at mga protina ay nagpapakita ng mga pangunahing pagkakaiba sa istruktura at pagganap:
- Ang isang polypeptide ay isang simpleng polimer ng mga amino-asido na nakaugnay sa covalent bonds ng peptide, habang ang isang protina ay isang kumplikadong molecule na nailalarawan sa pamamagitan ng isang matatag na istraktura na binubuo ng natitiklop na isa o higit pang mga polypeptide chain, na pinagsama ng mga di-covalent bond.
- Ang pangunahing tungkulin ng polypeptide ay ang pangunahing istraktura ng isang protina, habang ang isang protina ay isang kumplikadong tambalan, na may mga ligand na may-bisang mga site na nagpapagana nito na magbigkis sa mga tiyak at iba't ibang mga molecule at maging functionally aktibo sa cell.
